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2002年10月，党中央、国务院颁布《关于进一步加强农村卫生工作的决定》，提出了建立新型农村合作医疗制度（以下简称“新农合”）的任务。胡锦涛总书记、温家宝总理高度重视，多次作出重要批示，为新农合的试点工作和全面推进指明了方向，提出了明确要求。国务院成立了以吴仪副总理为组长的新农合部际联席会议，在吉林、浙江、湖北和云南四个省进行试点，并陆续在全国开展试点工作。从2003年到2007年，国务院连续四次召开全国新型农村合作医疗（试点）工作会议，统一思想，明确目标，部署工作,积极推进新农合制度健康发展。四年来，在各级党委和政府高度重视和正确领导下，各有关部门通力合作，广大农民群众积极参与，试点工作积极稳妥地推进。中央决定，从今年开始新农合制度建设由试点阶段转入全面推进阶段，2007年新农合覆盖的县（市、区）要达到全国县（市、区）总数的80％，2008年基本覆盖全国所有县（市、区）。据统计，截至2007年6月30日，全国开展新农合的县（市、区）达到2429个，占全国总县（市、区）的84.87%，参加合作医疗人口7.2亿，占全国农业人口的82.83%。全国新农合制度运行良好、成效显著，受到了广大农民群众的欢迎和社会各界的好评。
截至2007年6月30日，全国合作医疗基金本年度已筹集到位241.47亿元，其中，中央财政补助资金到位14.70亿元（中央财政上半年实际下拨93.97亿元），地方财政补助资金到位130.80亿元，农民个人缴费91.95亿元（含相关部门为救助对象参合缴费2.93亿元），其它渠道4.02亿元。
2007年上半年全国合作医疗基金支出总额为133.38亿元。其中，用于住院补偿110.08 亿元（占基金支出总额的82.53%）；以统筹基金形式进行门诊补偿8.11亿元（占基金支出总额的6.08%），以家庭账户形式进行门诊补偿11.80亿元（占基金支出总额的8.85%）；其他补偿2.29亿元（占基金支出总额的1.71%）；体检支出1.10亿元（占基金支出总额的0.83%）。从受益情况看，2007年上半年全国累计受益16719.84万人次。其中，住院补偿1440.91万人次，门诊补偿13664.51万人次，其它补偿215.24万人次，体检1399.18万人次。
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